我院成立功能神经外科，是全国首家功能神经外科领域的临床治疗和科研机构，其体制规划凝聚了专家的智慧与心血。陈鸿耀教授作为功能神经外科的领衔人，集多年神经科学领域的所学和丰富的疾病治疗经验，开设：癫痫、小儿脑瘫、帕金森病、三叉神经痛、面肌痉挛等疾病项目，治疗成功率达到98％以上，成为亚洲唯一获此殊荣的临床机构。癫痫中心借鉴国际同行多年的理念和经验，对顽固性癫痫的治疗与世界水平齐步走。采用微创技术，对慢性顽固性疼痛的治疗提供了一种终极选择的手段，使三叉神经痛等患者重返健康生活。针对日益增多的脑瘫患者，采用微创的、高选择性的和多水平的治疗，极大地缓解了他们的行走困难，增强了肢体灵活性。还成功地对一些严重的精神病患者实施了外科手术，使他们重返工作和学习岗位。