消化内镜检查、治疗室是厦门大学医学院抗癌中心协作单位，长期与福建医科大学消化内病研究中心、南方医科大学珠江医院肿瘤靶向治疗中心有着会诊技术支持的关系。开展各种消化道疾病内镜下介入治疗、晚期食道癌胃镜下食道内支架置入、内镜下胃肠道肿瘤的氩离子激光治疗。晚期食道癌光动力及内支架植入治疗项目获得福建省科技基金资助。