使用复方克霉唑偶可发生的不良反应包括：感觉异常、斑丘疹、水肿、继发感染等。
使用克霉唑可能产生的不良反应包括：红斑、刺痛、水疱、脱屑、水肿、荨麻疹及皮肤刺激反应。
局部使用皮质类固醇类药物引起的不良反应包括：烧灼感、过敏性痒疹、皮肤干燥、毛囊炎、多毛症、痤疮样皮疹、色素减退、口周炎、变应性接触性皮炎、皮肤浸润、继发感染、皮肤萎缩纹及粟粒疹等。
儿童局部使用皮质类固醇类药物已有引起丘脑-垂体-肾上腺(HPA)功能抑制、柯兴氏综合症、颅内高压等不良反应的报道。肾上腺抑制表现为线性生长抑制、体重增加延缓、血浆肾上腺素水平低下、ACTH应激反应消失；颅内高压表现为前额突出、头痛和双侧性视乳头水肿。
使用本品后最初3-5天，红斑消退，瘙痒减轻。体、股癣，皮肤念珠菌病患者使用本品1周后，手、足癣患者使用2周以上后症状未见好转的，应重新诊断。
体、股癣患者使用本品2周后，手、足癣患者使用4周以上后病情持续，应当停药，选择合适的其它抗真菌药物进行治疗，本品不推荐持续使用4周以上。
本品使用时不得采用封包方式。
使用时如发生刺激或过敏反应，应停止使用本品并进行适当的治疗。如同时伴有细菌感染，应同时使用抗生素，如没有出现预期的疗效，应停止使用本品，直到细菌感染被充分控制。如使用无效，应进行微生物检验，在进行其它抗菌治疗前确诊病情。
局部使用皮质激素药物，也可出现全身使用所致的不良反应，包括肾上腺(HPA)抑制、柯兴氏综合症、高血糖、糖尿等。长期或大面积使用本品会增加药物的全身吸收，应定期检测肾上腺抑制情况，一旦出现以上征兆，应停止用药或以活性较低的其它皮质激素类药物替代。停药后肾上腺功能会迅速恢复，偶有反跳现象，应注意皮质激素的全身补充。
本品禁用于眼科。
本品禁用于尿布所引起的皮炎。
