每日或隔日一次。使用方法如下：
在用药之前，将患处用生理盐水轻轻洗净。
出现感染时，患处可以使用合适的抗生素，然后再敷用本品：如果感染继续，暂停敷用本品，感染消除后，继续敷用本品。
本品可直接涂于患处，也可涂在纱布上，敷在患处。
胶原酶最佳pH范围是6-8，过高或过低pH都降低本品的活性，所以应引起适当的注意。
酶的活性同样受到去污剂、重金属离子的影响，例如，酶活性受一些防腐剂中使用的汞和银的抑制。当怀疑已经接触了这些东西时，在使用本品前应该用生理盐水仔细地反复冲洗患处。
还应避免含有金属离子和酸性溶液的浸泡，因为这样的溶液带有金属离子及pH会偏低。
清洁剂如过氧化氢溶液、次氯酸钠溶液、生理盐水与本品可配伍使用。
因为理论上酶清创可能增加染菌的危险，所以应该密切关注重症患者的全身细菌感染。
当本品涂于伤口之外的周围组织时，偶尔出现轻微的暂时性红斑，所以应将软膏小心涂抹在伤口上。