常用剂量不良反应的发生率较低。剂量加大至6mg/kg时，不良反应发生率显著增加，主要为周围神经炎及肝脏毒性，加用维生素B6虽可减少毒性反应，但也可影响疗效。
肝脏毒性：
本品可引起轻度-过性肝损害如血清氨基转移酶升高及黄疸等，发生率约为10%-20%。肝脏毒性与本品的代谢产物乙酰肼有关，快乙酰化者乙酰肼在肝脏积聚增多，故易引起肝损害。服药期间饮酒可使肝损害增加。毒性反应表现为食欲不佳、异常乏力或软弱、恶心或呕吐(肝毒性的前驱症状)及深色尿、眼或皮肤黄染(肝毒性)。
神经系统毒性：
周围神经炎多见于慢乙酰化者，并与剂量有明显关系。较多患者表现为步态不稳、麻木针刺感、烧灼感或手脚疼痛。此种反应在铅中毒、动脉硬化、甲亢、糖尿病、酒精中毒、营养不良及孕妇等较易发生。其他毒性反应如兴奋、欣快感、失眠、丧失自主力、中毒性脑病或中毒性精神病则均属少见．视神经炎及萎缩等严重毒性反应偶有报道。
变态反应包括发热、多形性皮疹、淋巴结病、脉管炎等。一旦发生，应立即停药，如需再用，应从小剂量开始，逐渐增加剂量。
血液系统可有粒细胞减少、嗜酸性粒细胞增多、血小板减少、高铁血红蛋白血症等。
其他如口干、维生寨B6缺乏症、高血糖症、代谢性酸中毒、内分泌功能障碍等偶有报道。
精神病、癫痫、肝功能损害及严重肾功能损害者应慎用本品或剂量酌减。
本品与乙硫异烟胺、吡嗪酰胺、烟酸或其他化学结构有关药物存在交叉过敏。
异烟肼结构与维生素B6相似，大剂量应用时，可使维生素B6大量随尿排出，抑制脑内谷氨酸脱羧变成γ-氨酪酸而导致惊厥．同时也可引起周围神经系统的多发性病变。因此成人每日同时口服维生素B650-100mg有助于防止或减轻周围神经炎及(或)维生寨B6缺乏症状。如出现轻度手脚发麻、头晕，可服用维生素B6或B6，若重度者或有呕血现象，应立即停药。
肾功能减退但血肌酐值低于6mg/100ml者，异烟肼的用量勿需减少。如肾功能减退严重或患者系慢乙酰化者则需减量．以异烟肼服用后24小时的血药浓度不超过1mg/L为宜。在无尿患者中异烟肼的剂量可减为常用量的一半。
肝功能减退者剂量应酌减。
用药前、疗程中应定期检查肝功能，包括血清胆红寨、AST，ALT，疗程中密切注意有无肝炎的前驱症状，一旦出现肝毒性的症状及体征时应即停药，必须待肝炎的症状、体征完全消失后方可重新应用本品，此时必须从小剂量开始，逐步增加剂量，如有任何肝毒性表现应即停药。
如疗程中出现视神经炎症状，需立即进行眼部检查，并定期复查。
慢乙酰化患者较易产生不良反应，故宜用较低剂量。
对实验室检查指标的干扰：
用硫酸酮法进行尿糖测定可呈假阳性反应，但不影响酶法测定结果。本品可使血清胆红素、丙氨酸氨基转移酶及门冬氨酸氨基转移酶的测定值增高。
服用异烟肼时每日饮酒，易引起本品诱发的肝脏毒性反应，并加速本品的代谢。因此须调整本品的剂量，并密切观察肝毒性征象。应劝告患者服药期间避免酒精饮料。
与肾上腺皮质激素(尤其泼尼松龙)合用时，可增加本品在肝内的代谢及排泄，导致本品血药浓度减低而影响疗效，在快乙酰化者更为显著，应适当调整剂量。
抗凝血药(如香豆素或茚满双酮衍生物)与本品合用时，由于抑制了抗凝药的酶代谢，使抗凝作用增强。
异烟肼为维生素B6的拮抗剂，可增加维生素B6经肾排出量，易致周围神经炎的发生。同时服用维生素B6者，需酌情增加用量。
本品不宜与其他神经毒药物合用，以免增加神经毒性。
与环丝氨酸合用时可增加中枢神经系统的不良反应(如头昏或嗜睡)，需调整剂量，并密切观察中枢神经系统毒性征象，尤其对于从事需要灵敏度较高工作的患者。
与乙硫异烟胺、毗嗪酰胺、利福平等其他有肝毒性的抗结核药合用时，可增加本品的肝毒性，尤其是已有肝功能损害者或为异烟肼快乙酰化者，因此应尽量避免合用或在疗程的头3个月密切随访有无肝毒性征象出现。
本品可抑制卡马西平的代谢，使其血药浓度增高，引起毒性反应；卡马西平则可诱导异烟肼的微粒体代谢，形成具有肝毒性的中间代谢物增加。
与对乙酰氨基酚合用时，由于异烟肼可诱导肝细胞色素P450．使前者形成毒性代谢物的量增加，可增加肝毒性及肾毒性。
与阿芬太尼合用时，由于异烟肼为肝药酶抑制剂，可延长阿芬太尼的作用：与双硫仑合用可增强其中枢神经系统作用，产生眩晕、动作不协调、易激惹、失眠等；与安氟醚合用可增加具有肾毒性的无机氟代谢物的形成。
本品不宜与酮康唑或咪康唑合用，因可使后两者的血药浓度降低。
与苯妥因钠或氨茶碱合用时可抑制二者在肝脏中的代谢，而导致苯妥因钠或氨茶碱血药浓度增高，故本品与两者先后应用或合用时，苯妥因钠或氨茶碱的剂量应适当调整。
不可与麻黄碱、颠茄同时服用，以免发生或增加不良反应。
