遗传毒性： Ames试验，小鼠淋巴瘤L5178Y细胞系试验、动物骨髓微核试验、人体淋巴细胞染色体试验结果均为阴性。
生殖毒性：大鼠经口给予氟康唑20mg/kg，可轻度延迟分娩过程，但不影响其生育力，大鼠围产期结果可见，雌鼠接受20mg/kg和40mg/kg时，某些动物出现难产和延迟分娩。主要表现为死胎数量轻度增加和存活新生率数量减少。大剂量氟康唑对大鼠分娩的影响可能与其可特异性地降低该种属动物的雌激素水平有关。在接受氟康唑治疗的妇女中尚未观察到这种激素水平的变化。
致癌性：小鼠和大鼠分别按2.5、5、或10毫克/公斤体重/日剂量（约为人体推荐剂量的2～7倍）口服氟康唑24个月，提示氟康唑无致癌作用，但雄性大鼠接受本品剂量为5mg/kg和10mg/kg，连续给药24个月，可见动物肝细胞腺瘤发生率增高。