革兰阳性菌引起的下列各种感染性疾病：
扁桃体炎、化脓性中耳炎、鼻窦炎等；
急性支气管炎、慢性支气管炎急性发作、肺炎、肺脓肿和支气管扩张合并感染等；
皮肤和软组织感染：疖、痈、脓肿、蜂窝组织炎、创伤、烧伤和手术后感染等；
泌尿系统感染：急性尿道炎、急性肾盂肾炎、前列腺炎等；
其它：骨髓炎、败血症、腹膜炎和口腔感染等。
厌氧菌引起的下列各种感染性疾病：
脓胸、肺脓肿、厌氧菌性肺炎；
皮肤和软组织感染、败血症；
腹内感染：腹膜炎、腹腔内脓肿。
胃肠道反应：偶见恶心、呕吐、腹痛及腹泻；
过敏反应：少数病人可出现药物性皮疹；
偶可引起中性粒细胞减少，嗜酸性粒细胞增多，血小板减少等，一般轻微为一过性；
少数病人可发生一过性碱性磷酸酶、血清转氨酶轻度升高及黄疸；
极少数病人可产生伪膜性结膜炎。
本品作用机制与林可霉素相同，细菌对本品与林可霉素有完全交叉耐药性，对林可霉素高度耐药的患者，也不适宜使用本品。
一般胃肠道不适，可/影响治疗，但本品有可能引起伪膜性结肠炎，应予高度重视，如出现剧烈腹痛，频繁腹泻，伴水样和血样便等症状，应停止用药，严重时应输液，处理无效则需服用万古霉素。
肝功能损害患者、严重肾功能损害患者应慎用。
未足月婴儿慎用。
有胃肠疾病史，特别是溃疡性结肠炎、局限性肠炎或抗生素伴随性结肠炎的患者应慎用。
本品治疗乙型溶血性链球菌感染，连续用药应不少于10天，以防止急性风湿性发生。
本品与神经肌肉阻断剂，中枢性麻醉剂、阿片类具呼吸抑制作用的镇痛药合用，可使神经肌肉阻断现象和呼吸抑制现象加强；与抗肌松药合用可使抗肌松作用减弱。
因本品有可能引起伪膜性结肠炎，与抗蠕动性止泻药合用，可能使肠内毒素延迟排出，从而导致腹泻延长或加剧。
氯霉素和红霉素均可置换或阻止克林霉素与细菌核糖体50S亚基的结合，故不宜与本品合用。
本品与庆大霉素、粘菌素合用，可能使抗菌作用增强。
如出现伪膜性肠炎，选用万古霉素，口服0.125-0.5g。每日4次进行治疗。
可增强吸入性麻醉药的神经肌肉阻断现象，导致骨骼肌软弱和呼吸抑制或麻痹(呼吸暂停)，在手术中或术后同用时应注意。以抗胆碱酯酶药物或钙盐治疗可望有效。
与抗蠕动止泻药、含白陶土止泻药同用：克林霉素在疗程中，甚至在疗程后数周有引起伴严重水样腹泻的伪膜性肠炎可能。因可使结肠内毒素延迟排出，从而导致腹泻延长和加剧，故抗蠕动止泻药不宜同用。含白陶土止泻药和克林霉素同时口服，后者的吸收将显著减少，故两者不宜同时服用，须间隔一定时间(至少2小时)。
本品具神经肌肉阻断作用，与抗肌无力药合用时将导致后者对骨骼肌的效果减弱。为控制重症肌无力的症状，在合用的疗程中抗肌无力药的剂量应予调整。
氯霉素和红霉素在靶位上均可置换本品，或阻抑后者与细菌核糖体50S亚基的结合，体外试验显示本品与红霉素具拮抗作用，故本品不宜与氯霉素或红霉素合用。
与阿片类镇痛药合用，本品的呼吸抑制作用与阿片类的中枢呼吸抑制作用可因累加现象而有导致呼吸抑制延长或引起呼吸麻痹(呼吸暂停)的可能，故必须对病人进行密切观察或监护。
本品可增强神经肌肉阻断药的作用，两者应避免合用。
在Spartan Sprague-Dawley大鼠和Beagle犬中进行的为期1年的口服毒性研究，给药剂量为300mg/kg/日(按照mg/m2折算后分别相当于最高成人推荐剂量的1.6和5.4倍)，该研究显示，受试动物可较好地耐受克林霉素。在克林霉素治疗组与对照组之间无病理学差异。给予大鼠600 mg/kg/日(按照mg/m2折算后约相当于最高成人推荐剂量的3.2倍)克林霉素共6个月，耐受良好。但，犬在该剂量(按照mg/m2折算后约相当于最高成人推荐剂量的10.8倍)出现呕吐、不进食和体重下降。
致癌作用、致突变作用、生殖毒性
尚未在动物中进行克林霉素的长期研究，以评价其潜在的致癌性。已经进行了基因毒性试验，包括对大鼠微核试验和Ames沙门菌回复突变试验。这两项试验均为阴性。
在大鼠中进行了生殖力研究，经口给予高达300mg/kg/日的剂量(按照mg/m2折算后约相当于最高成人推荐剂量的1.6倍)未发现对生育或交配能力有任何的影响。