本品适用于敏感原生动物和厌氧菌引起的感染。
用于毛滴虫引起的男女泌尿生殖道感染。
用于阿米巴原虫引起的肠、肝阿米巴虫病（包括阿米巴痢疾、阿米巴肝脓肿）。
用于贾第鞭毛虫病。
用于厌氧菌感染：如败血症、脑膜炎、腹膜炎、手术后伤口感染、产后脓毒病、脓毒性流产、子宫内膜炎以及敏感菌引起的其他感染。
用于预防各种手术后厌氧菌感染。
毛滴虫病：
急性毛滴虫病：一次性服药，成人一次1500毫克(12粒)，晚饭后顿服。儿童25毫克/公斤/天，一次顿服。
慢性毛滴虫病：成人每次500毫克(4粒)，每日二次，共五天。性伙伴应给予同样的治疗，以避免重复感染。
阿米巴虫病：
阿米巴虫痢疾：成人及体重35公斤以上的儿童，每次1500毫克(12粒)，晚饭后顿服，连服三天；体重60公斤以上者，每次1000毫克(8粒)，每日两次，饭后口服，连服三天；体重35公斤以下儿童，40毫克/公斤，一次顿服，饭后口服，连服三天。
其他阿米巴虫病：成人及体重35公斤以上儿童，每次500毫克(4粒)，每日二次；体重35公斤以下儿童，25毫克/公斤，一次顿服，连服5—10天。
贾第鞭毛虫病：成人及体重35公斤以上的儿童，晚上顿服1500毫克(12粒)，服药1—2天；体重35公斤以下儿童，40毫克/公斤，一次顿服，服药1—2天。
厌氧菌感染：预防术后感染：手术前12小时口服1500毫克(12粒)，以后每次500毫克(4粒)，每日二次，服药至手术后3—5天。
厌氧菌感染：成人及体重35公斤以上的儿童，每次500毫克(4粒)，每日二次；体重35公斤以下儿童，40毫克/公斤，分二次口服。
可见轻度副作用嗜睡、头痛、胃肠不适（包括恶心、呕吐）。
个别患者可见中枢神经系统障碍：如头痛、震颤、强直、癫痢发作、运动失调、疲劳、眩晕、意识短暂消失或周围神经病。
味觉障碍，肝功能异常和皮肤反应。
奥硝唑可增强香豆素口服抗凝药的作用，故当两者同时使用时，应调整抗凝药的剂量。
奥硝唑可延长维库溴铵的肌肉松弛作用。
巴比妥类药物、雷尼替丁、西米替丁可加快奥硝唑的消除，降低其疗效并可凝血，当使用奥硝唑时应避免合用。
重复给药毒性：大鼠连续2年给予本品剂量为400毫克/公斤/日，未见对动物的寿命的影响，也未引起严重的功能或形态学改变。犬连续1年给药，剂量达250毫克/公斤/日时，出现中枢神经系统症状，这些症状在硝基咪唑类衍生物的大鼠试验中均可见到。
遗传毒性：与其它硝基咪唑类药物类似，本品对多种菌株具有致突变作用，但是人淋巴细胞和小鼠显性致死试验表明，本品对哺乳类动物细胞染色体无影响。
生殖毒性：在所进行的大鼠、小鼠和家兔的高剂量研究中，对胎儿和围产期无明显影响。大鼠和小鼠给药剂量达400毫克/公斤/日，家兔剂量达100毫克/公斤/日时，未见致畸作用。经口给药可抑制雄性大鼠的生殖能力，但是与其它5-硝基咪唑类化合物不同的是，本品不抑制精子的生成。但是，目前尚无充分和严格对照的孕妇临床研究资料。由于动物生殖研究并不能完全预测药物对人的影响，所以只有当确实需要时才可以在怀孕期间服用本品。
致癌性：大鼠连续2年给药剂量达400毫克/公斤/日时，未见本品的致癌性。