不良反应的发生率为5%～23%，主要表现为：
循环系统的不良反应：主要表现为心悸、心绞痛、低血压及心电图异常。
血液系统的不良反应：有白细胞减少，血小板降低，牙龈、子宫或结合膜下出血，也有引起脑出血和上消化道出血并休克的报道。
消化系统的不良反应：主要表现为口干、恶心、呕吐、腹泻、腹痛、便秘及纳差等；有时出现肝脏异常，表现为TTT增高或增高。
过敏反应：有皮肤发红、瘙痒、皮疹、环形红斑、剥皮性皮炎、肢端静脉扩张、四肢末梢神经水肿、急性喉头水肿和过敏性休克等。
神经系统不良反应：头痛、头晕、嗜睡、烦躁不安等。
其他不良反应：有乏力、发热、关节肌肉疼痛、听力下降等。
1．应用本品前，应明确诊断，严格排除出血性疾病，测试有关实验室指标，如血液黏度、血小板聚集度、凝血酶原时间等。
2．有下列疾病者慎用：
1. 低血压、血容量不足。 2. 血小板减少症。 3. 非高粘滞血症、非血小板聚集亢进。 4. 过敏性体质。 3．本品禁用静脉注射或肌肉注射。藻酸双酯钠是以海藻提取物为基础原料，属多糖类化合物，类肝素药。本品能降低血液黏度，改善微循环。
另外，本品能使凝血酶失活，抑制由于血管内膜受损、腺苷二磷酸(ADP)和凝血酶激活等所至的血小板聚集，具有抗凝血的作用。本品应用后还能使血浆中总胆固醇、甘油三酯和低密度脂蛋白(LDL)的含量降低，高密度脂蛋白(HDL)D 水平升高，具有降血脂的作用。