可有恶心、皮疹、便秘、乏力、头痛、头晕、失眠。舌苔发黑、灰褐色便，停药后即自行消失。
少数患者服药后引起ALT、AST及血清肌酐轻度升高。
偶见服药后出现定向力障碍、嗜睡、焦虑等精神状态。
也可出现与雷尼替丁相关的不良反应，包括血液系统：粒细胞减少等，心血管系统：心动过缓等，生殖内分泌系统：可逆性阳痿、男性乳房发育。上述情况的发生频率均很少。
肝、肾功能不全者应适当减量或慎用。
大剂量长期使用可持续降低胃液酸度，有利于细菌在胃内繁殖，从而使食物内硝酸盐还原为亚硝酸盐，形成N-亚硝基化合物，因此本品不宜长期大剂量使用（不宜超过6周）。
胃溃疡患者用药前应排除恶性肿瘤的可能。
与克拉霉素联用时，机体血清雷尼替丁、枸橼酸铋及14-羟克拉霉素的浓度分别增加57%、48%及31%；
与大剂量抗酸药（170mEq）合用，血清雷尼替丁浓度下降28%，血清枸橼酸铋的浓度也下降；
与阿司匹林合用，乙酰水杨酸的吸收轻度下降；
食物可降低铋剂的吸收，有实验表明餐后服用800mg枸橼酸铋雷尼替丁，其吸收率及吸收度较餐前半小时服用者分别下降50%及25%，但不影响临床疗效。
雷尼替丁
遗传毒性：在标准的细菌诱变试验（沙门氏菌、大肠杆菌）中，雷尼替丁在推荐的最大试验浓度剂量下未发现有诱突变作用。在项显性致死试验中，雄性大鼠一次经口给予雷尼替丁1000mg/kg，给药后的9个星期内（每周2次）的交配未受影响。
生殖毒性：人鼠和家兔经口给予雷尼替丁（剂量达人口服剂量的160倍），未见雷尼替丁对于动物的生育力和胎仔有明显影响。
致癌性：大鼠和小鼠终生经口给予雷尼替丁（剂量达2000mg/kg），未表明出致癌作用。