在推荐口服剂量下，病人能较好的耐受，个别病人可发生腹胀、腹痛、口苦、皮疹。
体外细胞培养试验发现，多库酯钠对肝细胞具有一定的细胞毒作用，多库酯钠单独使用或者与酚丁类药物（oxyphenisatin）同时使用，均对肝细胞具有细胞毒性，但其肝脏毒性未在体内研究和临床研究中得到证实。
多库酯钠可能增强其它药物肝脏毒性，故不宜与其它具有肝毒性的药物同时使用。
多库酯钠可引起肠道粘膜的形态学改变，但这种改变的病理生理学意义尚不明确。
如出现腹痛、恶心、呕吐等症状超过二周，使用本品前需咨询医师。
如使用本品后无效或便血，需立即停止使用咨询医师。
本品可增加石蜡油等的吸收，不宜与石蜡油等矿物油同时使用。
本品作用温和，起效也较缓慢，口服后1～3天才能见效，不宜用于肠镜手术前清洁肠道的患者或需要立即通便的患者。
本品口服后基本不吸收，药物均随肠内容物排出，因此可能影响肛管手术患者伤口的愈合；
本品与其它药物同时服用时，可使药物的吸收或肝脏摄取增加。
本品可增加液状石蜡的吸收。
多库酯钠可能增强其他药物的肝毒性，故不宜与其他具有肝毒性的药物同时使用。
