可供肌内注射、静脉注射或静脉滴注。
成人常用量：一般感染，一次1-2g，每12小时l次；严重感染，一次2~3g，每8小时1次。接受血液透析者，透析后应补给1次剂量。成人一日剂量不超过9g，但在免疫缺陷病人有严重感染时，剂量可加大至每日12g。
小儿常用量：每日50-200mg/kg，分2~3次静脉滴注。
制备肌内注射液，每1g药物加灭菌注射用水2.8ml利多卡因注射液1ml，其浓度为250mg/ml。静脉徐缓注射者，每1g药物加葡萄糖氯化钠注射液40ml溶解；供静脉滴注者，取1-2g头孢哌酮溶解于100-200ml葡萄糖氯化钠注射液或其他稀释液中，最后药物浓度为5-25mg/ml。每1g头孢哌酮的钠含量为1.5mmol（34mg）。皮疹较为多见，达2.3%或以上。
少数病人尚可发生腹泻、腹痛、嗜酸粒细胞增多、轻度中性粒细胞减少。
暂时性血清氧基转移酶、碱性磷酸酶，尿素氮或血肌酐升高。
血小板减少、凝血酶原时问延长等可见于个别病例。偶有出血者，可用维生素K预防或控制。
菌群失调可在少数病人出现。
应用本品期间饮洒或接受含酒精药物或饮料者可出现双硫仑（disulfiram）样反应。
本品治疗婴儿感染也获较好疗效，但对早产儿和新生儿的研究尚缺乏资料。
对诊断的干扰：用硫酸铜法进行尿糖测定时可出现假阳性反应，直接抗球蛋白（Coombs）试验早阳性反应。产妇临产前应用本品，新生儿此试验亦可为阳性。偶有碱性磷酸酶、血清丙氢酸氨基转移酶、血清门冬氢酸氨基转移酶，血清肌酐和血尿素氮增高。
肝病和（或）胆道梗阻病人，半衰期延长（病陆严重者延长2-4倍），尿中头孢哌酮排泄量增多；但肝病、胆道梗阻严重或同时有肾功能减退者，胆汁中仍可获得自效治疗浓度；给药剂量须予适当调整，且应进行血药浓度监测。如不能进行血药浓度监测时，每天给药剂量不应超过2g。
部分病人用本品治疗可引起维生素K缺乏和低凝血酶原血症，用药期间应进行出血时间、凝血酶原时间监测。同时应用维生素K1可防止出血现象的发生。
长期应用头孢哌酮可引起二重感染。
交叉过敏：对任何种一种头孢菌素过敏者对本品也可能过敏。
本品与氨基糖苷类抗生素（庆大霉素和妥布霉素）联合应用时对肠杆菌科细菌和铜绿假单胞菌的某些敏感菌株有协同作用。
本品能产生低凝血酶原血症、血小板减少症，与下列药物同时应用时，可能引起出血：抗凝药肝素，香豆素或茚满二酮衍生物、溶栓药、非甾体抗炎镇痛药（尤其阿司匹林、二氟尼柳或其他水杨酸制剂）及磺吡酮等。
本品化学结构中含有甲硫四氮唑侧链，故应用本品期间，饮酒或静脉注射含乙醇药物，将抑制乙醛去氢酶的活性，使血中乙醛积聚，出现嗜睡、幻觉等双硫仑样反应。因此在用药期间和停药后5天内，病人不能饮酒、口服或静脉输入含乙醇的药物。
本品与氨基糖苷类抗生素联合用药时不可同瓶滴注，因可能相互影响抗菌活性。
本品与下列药物注射剂有配伍禁忌：阿米卡星、庆大霉素、卡那霉素B、多西环素、甲氯芬酯、阿马林（缓脉灵）、苯海拉明、门冬酸钾镁、盐酸羟嗪（安太乐）、普鲁卡因胺、氨茶碱、丙氧拉嗪、细胞色素C、喷他佐辛（镇痛新）、抑肽酶等。
