胆囊胆固醇结石一必须是X射线能穿透的结石，同时胆囊收缩功能须正常；
胆汁淤积性肝病（如：原发性胆汁性肝硬化）；
胆汁反流性胃炎。
胆囊胆固醇结石和胆汁淤积性肝病
按时用少量水送服。按体重每日剂量为10mg/kg,即：
溶石治疗：一般需6～24个月，服用12个月后结石未见变小者，停止服用，治疗结果根据每6个月进行超声波或X射线检查判断。
胆汁反流性胃炎
晚上睡前用水吞服，必须定期服用，一次一粒(250mg)，一日一次。一般服用10～14天，遵从医嘱决定是否继续服药。
不良反应的评估基于下列频率数据：
胃肠道紊乱：
临床试验中，用熊去氧胆酸进行治疗时稀便或腹泻的报告常见。
在治疗原发性胆汁性肝硬化时，发生严重的右上腹疼痛十分罕见。
肝胆功能紊乱：
用熊去氧胆酸进行治疗时，发生胆结石钙化的病例十分罕见。
治疗晚期原发性胆汁性肝硬化时，发生肝硬化失代偿的情形十分罕见，停止治疗后部分恢复。
过敏反应：
发生荨麻疹十分罕见。
下列情况下禁用熊去氧胆酸胶囊：
急性胆囊炎和胆管炎；
胆道阻塞（胆总管和胆囊管）：
如果胆囊不能在X射线下被看到、胆结石钙化、胆囊不能正常收缩以及经常性的胆绞痛等不能使用熊去氧胆酸胶囊。
熊去氧胆酸胶囊必须在医生监督下使用。
主治医师在治疗前三个月必须每4周检查一次患者的一些肝功能指标如AST（SGOT）、ALT（SGPT）和γ-GT等，并且以后每3个月检查一下肝功能指标。
为了评价治疗效果，及早发现胆结石钙化，应根据结石大小，在治疗开始后6～10个月，做胆囊X射线检查（口服胆囊造影）。于站立位及躺卧位（超声监测）拍X射线照片。熊去氧胆酸胶囊不应与考来烯胺（消胆胺）、考来替泊（降胆宁）以及含有氢氧化铝和/或蒙脱石（氧化铝）等抗酸药同时服用，因为这些药可以在肠中和熊去氧胆酸结合，从而阻碍吸收，影响疗效。如果必须服用上述药品，应在服用该药前两小时或在服药后两小时服用熊去氧胆酸胶囊。
熊去氧胆酸胶囊可以增加环孢素在肠道的吸收，服用环孢素的患者应做环孢素血清浓度的监测，必要时要调整服用环孢素的剂量。
个别病例服用熊去氧胆酸胶囊会降低环丙沙星的吸收。
基于熊去氧胆酸可以降低钙拮抗剂尼群地平的血浆峰浓度（Cmax）和曲线下面积（AUC）以及1例与氨苯砜相互作用（治疗作用降低）的报告和体内外研究结果，推测熊去氧胆酸可能会诱导药物代谢酶细胞色素P450 3A4。因此和经过此酶类代谢的药物同时服用应注意，必要时调整给药剂量。动物的急性毒性实验表明无毒性作用；
亚慢性毒性实验显示，猴子在高剂量时会有一些肝毒性（包括一些酶的改变）和一些形态学上的改变如胆管的肥大、门静脉炎症和肝细胞坏死，这些毒性反应最可能归因于熊去氧胆酸代谢物胆石酸，其在猴子体内没有被代谢去毒（与人类不同），临床用药经验证实所述肝毒性反应在人类没有明显关联性；
经过小鼠和大鼠的长期研究发现无致癌潜力；
无致突变作用。
在大鼠实验中，只有当熊去氧胆酸剂最达到2000mg/kg体重（相当于70公斤体重的人每天服用560粒熊去氧胆酸胶囊的剂量）时，会导致尾部畸形；剂量达300mg/kg体重时未见对家兔的致畸作用，对大鼠的生育力没有影响，同时不削弱大鼠围产期和出生后的发育。