本品的不良反应多种多样：
瞳孔缩到针尖大小时，可出现视觉模糊或复视；
便秘：有局部胃肠道因素，也有中枢性因素；
抗利尿作用以吗啡为明显，兼有输尿管痉挛时，可出现少尿、尿频、尿急、排尿困难。
体位改变血压下降时，常有晕眩感、步态不稳、以及疲乏感；
中枢神经活动处于抑制状态时，临床表现可有嗜睡、梦幻、头痛眩晕等，继而觉口干、食欲不振、饮食乏味以及恶心哎吐等不适，后者更多见于急症和第一次给药时。
组氨的释放可引起面颊潮红，汗多；
胃肠道刺激和胆管痉挛可致腹痛
可引起情绪紧张不安或难以入眠等反应。
少见但有危险的不良反应:
呼吸频繁减慢又很不规则、潮气量小、提示呼吸抑制严重，有些阿片类药又可引起骨骼肌主要是胸壁呼吸肌低直，尤其是量大、快速静注时容易出现；
中枢神经毒性表现，以惊厥、幻觉、耳鸣、震颤、动作不能自制等最为突出；
中枢性抑制过度，以神智模糊、抑郁、消沉、迟钝等为多见，小儿且可出现阵发性兴奋激动，大剂量可引起呼吸抑制、血压上升及心率加速。
组胺释放过多，可诱发弹性荨麻疹，皮肤瘙痒、颜面红润微肿、支气管痉挛、喉痉挛、喉水肿等。
中毒性腹泻，毒物聚集于肠腔尚未排尽；
急性呼吸抑制，通气不足；
遇有血液病或血管损伤出现凝血异常时，以及须作穿刺的局部有在炎症时，不得作硬膜外或蛛网膜下隙给药，成断时由此给药也并不能使症状改善
对诊断的干扰：
可能促使脑 液压升高；
吗啡能促使胆道括约肌收缩，使胆管系统的内压上升；可使血浆淀粉酶和脂肪酶均升高；
停药至少24小时后才能作血清碱性磷酸酶、丙氨酸氨基转移酶、门冬氨酸氨基转移酶、胆红素、乳酸脱氢酶等测定，以免假阳性出现。
下列情况应慎用：
哮喘急性发作、慢性尤其是病理性呼吸功能不全；
心律失常、心动过缓；
惊厥或有惊厥史的患者；
精神失常有自杀意图时；
脑外伤颅内压高或颅内病变，可使呼吸抑制或颅内压升高更严重，给药后瞳孔缩小，对光反射不明，可因而延误确诊；
肝肾功能不全，颅内压增高慎用。
甲状腺功能低下；
小儿、老年和恶病质等患者；
对吗啡有耐受性的人，使用本品能减弱吗啡的镇痛作用，并可促使成瘾者产生成断症状。
给药过程中应监测呼吸和循环等有关指标，其中以呼吸最为重要，硬膜外或蛛网膜下腔给药后，尤其是吗啡，呼吸的随访监测至少12小时左右，以便及早发现呼吸抑制。
本品连续长期使用可出现依赖性。有2列连续用药1年以上，也出现成瘾现象，切不可滥用。
吩噻嗪类中枢性抑制药以及三环类抗抑郁药等与本类药同时并用，呼吸抑制和（或）低血压可更期显，便秘也增加，依赖性更容易产生，用量应彼此配合互减。
高血压治疗用药不论是作用于神经节的如胍乙啶或美加明，利尿药如氢氧嗪等，或其他药物如金则烷胺、溴隐亭，左旋多巴、利多卡因、亚硝酸盐、普鲁卡因酰胺、奎尼丁等，与本类药同用时，有发生体位性低血压的危险，给药后立即随访监测。
与M胆碱药尤其是阿托品并用时，不仅便秘严重，而且可有麻痹性肠粳阻和尿潴留的危险。
静注硫酸镁后的中枢性抑制，尤其是呼吸抑制和低血压，会因同时使用阿片类药而加剧。
阿片类镇痛药，通过引起胃肠道蠕动徐缓，括约肌痉挛，可使甲氧氯普胺（胃复安）应有的效应不明。
应先停用单胺氧化酶抑制药（如蚨喃酮、丙卡巴肼等）14-21天后，才可应用本类药，尤其是哌替啶、芬太尼等；而且应先试用小量（1/4常用量），以免发生难以预料的、严重的、足以致死的循环虚脱，后者的先驱症状一般为；激动（狂燥）、多汗、僵直、血压很高或很低、呼吸抑制严重、昏迷、惊厥或（和）高热。
