现下设有门诊西药房、第二门诊部药房、住院药房、中药房、制剂室（2006年1月已停止制剂的配制）、药检室、药库等部门，负责组织实施包括中西药的调剂、制剂和药品采购供应及药品质量控制等药事管理工作。随着国家药事管理的不断提升和完善，科室的管理制度和管理手段也在不断地健全和规范。科室配置有紫外可见分光光度计、电子分析天平、医学显微镜、全自动旋光仪、pH计、751分光光度计、微粒机、高压蒸汽灭菌器、蒸馏塔等设备。