自治区中医医院理疗科是全疆唯一，以中药为特色，采用传统的中医理论和理疗新技术相结合的治疗方法。对内科的呼吸系统疾病、消化系统疾病、慢性肾炎、老年性膀胱炎、泌尿系统疾病，妇科疾病、骨科的肌肉骨骼组织损伤、颈椎病、腰椎病、普外科的脉管炎、伤口感染、术后伤口愈合、皮肤科带状泡疹、过敏性皮炎、湿疹等科室的大部分疾病都有明显疗效。