儿科是中国人民解放军总医院的重点学科，由小儿内科和小儿外科组成，治疗儿科常见病、多发病。先后获得军队科技进步2等奖2项，取得军队医疗成果二等奖一项，军队医疗成果三等奖一项，军队科技进步三等奖三项，全国中青年优秀科技论文大奖赛一等奖一项，二等奖一项。
先进设备：
CO2孵箱、超净台，倒置显微镜，荧光显微镜、PCR仪，高速离心机、低温冰箱、直肠测压仪、生物反馈治疗仪、C型臂等大型设备。
