百色市中医医院的前身是柳州铁路局百色铁路医院，创建于1997年。2004年整建制移交百色市人民医院管理，成为百色市人民医院城东分院。2008年9 月，被百色市人民政府确定为百色市中医医院，成为全市唯一的市级中医医院，增挂百色市民族医医院、百色市民族医药研究所两块牌子。

    医院现占地总面积15328平方米，建筑面积8400平方米。拥有飞利浦数字化X射线摄影系统（DR）、飞利浦彩超、奥林巴斯内镜、内镜数字诊疗系统、全自动生化分析仪、麻醉机、三维多功能牵引床、神经损伤治疗仪、太空舱中药熏蒸机、中药密闭煎药机、耳声发射仪、电子阴道镜、宫腔镜、耳内镜、鼻内镜、支气管镜等各种医疗设备。是集医疗、教学、科研、预防保健、康复为一体的中医医院。医院现有职工229人，其中专业技术人员181人，高级职称8人，教授1 人，副教授7人。

    目前，医院下设19个临床医技科室（内科、外科、妇产科、儿科、急诊科、口腔科、眼科、耳鼻咽喉科、皮肤科、手麻科、药剂科、预防保健科、推拿科、康复科、壮医学科、检验科、放射科、B超室、心电图室等）、3个卫生所（田东卫生所、平果卫生所、田林卫生所）、1个分院（贵州兴义铁路医院）和1个社区卫生服务中心（城东社区卫生服务中心）。拥有自治区中医药管理局重点建设专科1个（壮医学科）、院级重点专科3个（妇产科、针灸推拿科、康复科）。医院的推拿科、康复科是桂西地区技术力量最雄厚、分区最全、环境优雅、服务项目最多的部门。

    医院服务范围辐射到百色市各县区的广大民众，还惠及了桂、滇、黔三省交界各市县（州）的人民。医院不仅采用西医的治疗方法，而且还采用烫疗、针灸、手法、推拿、拔罐、封堵、刮痧、反射、贴敷、磁疗、小针刀及中药等中医及民族医学治疗、康复及保健办法以满足患者及民众对健康的需要。

    百色市中医医院是百色市医保、右江区医保、南宁铁路局医保及新农合定点医疗机构，医院妇产科、外科、耳鼻咽喉科长期开展优惠服务活动，住院总费用按本市三级医院同类疾病50%左右收取，部分手术如剖宫产术、阑尾切除术等还实行限价收费，对住院病人往返路程100公里内救护车免费接送或送到车站。对特困病人还给予更大优惠。

    按照百色市市政府规划，百色市中医医院拟在2013年整体搬迁，新医院占地面积34800平方米，建筑面积50000平方米，床位500张。医院将成为一所具有浓厚中医药文化氛围，集医疗、保健、康复、养生、民族医药人才培训等功能的现代化中医医院。