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巴彦淖尔市（原巴盟）蒙医院是在1961年始建的巴彦淖尔市（原巴盟）中蒙医药科学研究所的基础上1984年挂牌成立的。现挂有“巴彦淖尔市（原巴盟）蒙医院”、“巴彦淖尔市（原巴盟）蒙医药科学研究所”两牌子，2002年被原巴盟行署及主管局批准为“巴彦淖尔市（原巴盟）第三医院”。 　　巴彦淖尔市蒙医院是巴彦淖尔地区唯一集医疗、蒙西医结合、蒙医药科研、蒙医药教学于一体的民族医疗机构，是全巴彦淖尔市市直单位职工医疗保险定点医疗机构、市级文明单位。 　　现全院职工76人，其中卫生技术人员69人。本科16人，专科6人，中专31人。主任医师1人，副主任医师8人，主治医师27人，医（护）师（士）33人。 　　分科情况：我院分有蒙医Ⅰ科、蒙医Ⅱ科、西医内儿科、外妇科、手术室、护理部、蒙医皮肤科、药局、蒙药制剂室、蒙医五疗室、放射科、化验室、B超室、心电图、脑彩超室、蒙药资料研究室及其他行政科室。 　　医药设施：阿帕奇全身彩超、500MAX光机、经颅多普勒、24小时动态心电（浩特Horter）、24小时动态血压、心电监护仪、呼吸机、除颤起搏监护仪、半自动生化分析仪、全自动血球计数仪、尿液分析仪、心电图机、多功能脊柱康复牵引床、电磁式多功能药浴器、超声波治疗仪、微波治疗仪、胶囊机、不锈钢打丸机、粉碎机、搅拌机及其他制剂设备。 　　制剂规模及蒙成药种类：我院制剂室经2001年自治区药监局验收合格，并发放“制剂许可证”。制剂室占地面积960m2，建筑面积260m2，生产制剂品种111种，全部严格按“内蒙古自治区蒙成药标准”配伍和配制。其中水丸有60种、胶囊有10种、散剂21种、汤剂20种。