启东市中医院是一所具有中西医结合特色的,集医疗、教育、科研为一体的市级综合性医院、二级甲等医院、国家级爱婴医院、南京中医药大学实习医院、上海中山医院医疗部启东分部、启东市华侨诊疗中心。

    医院十分重视科技人才的培养和建设。现有工作人员338名，其中具有高级职称43人，中级职称71人，硕士研究生8人。拥有江苏省有突出贡献中青年专家1人、省“333工程”培养对象1人、南通市科技专业技术拔尖人才3人、南通市新世纪科学技术带头人培养对象2人、南通市名中医2人。科室设置较为完善，设有临床一级科室15个：急诊科、内科、中医科、外科、骨伤科、妇产科、儿科、眼科、耳鼻咽喉科、口腔科、皮肤科、针灸科、推拿科、肛肠科、麻醉科。设有8个中心和重症医学科病房：华侨医疗中心、内窥镜诊疗中心、无张力疝修补中心、腰椎间盘突出症治疗中心、眼科中心、白内障复明中心、血液净化中心、碎石中心、重症医学科病房(ICU)。临床二级专业组21个：内科分设心血管、神经、消化、肾脏内分泌、呼吸、血液、肿瘤专业组；外科分设骨科、普外、胸外、脑外、泌尿、烧伤整形、肿瘤专业组；中医科分设中医内科、中医妇科、中医外科、肝胆病、脾胃病专业组；妇产科分设产科、妇科专业组。业务一级科室7个：检验科、放射科（分设普放室、CT室、磁共振室）、病理科、功能科（分设超声室、心电图室、脑电图室、经颅多普勒室、碎石排石室、高压氧舱室）、药剂科（分设制剂室、门诊西药房、病区西药房、中药房、成药房、中药库、西药库、成药库）、手术室、供应室。中西医结合专病门诊12个：慢性肝炎、结石病、慢性肾炎、不孕症、咳喘、声带小结、溃疡性肝炎、银屑病、颈椎病、前列腺病、腰椎间盘突出症、疑难杂症。耳鼻咽喉科、普外科是南通市重点专科。中医科、肛肠科、皮肤科、针灸推拿科、骨伤科等特色专科，在社会上有着广泛的影响力，多年来受到了众多患者的青睐。

    医院注重高新技术的开发和应用，医疗技术迅速发展。除了开展常见的手术外，还开展了放射介入治疗，心肌梗塞、脑梗塞的早期溶栓治疗，永久性和临时性心脏起博器安置，胰十二指肠联合切除，肝切除，左上腹联合脏器切除，无张力疝气修补，腹腔镜下胆囊摘除、腹腔镜下妇科手术，肺癌切除，食道癌切除，全髋置换，人工股骨头置换，交锁髓内钉应用，全喉切除发音重建，上颌骨截除，颈淋巴结清扫，白内障、青光眼手术，广泛子宫切除，盆腔淋巴结清扫，子宫肌瘤射频消融治疗，各种颅脑外伤颅内血肿清除，颅骨修补等高难度手术。

    医院安装了中心供氧、中心吸引系统。除配齐一般的诊疗设备外，还拥有永磁型磁共振机、德国西门子全身螺旋CT机、美国通用公司彩超、日立全自动生化仪，意大利原装进口1000毫安多功能数字化X光机（DSA）、费森尤斯4008S和瑞典金宝AK95S多功能血透仪、血气分析仪、国内最新型的体外冲击波碎石机、高压氧舱、全自动呼吸机、爱克发CR摄片机、心电监护仪、心电工作站、心脏除颤起搏仪、运动平板仪、电子胃镜、电子肠镜、腹腔镜、前列腺汽化仪、血凝仪、脑电地形图、经颅彩色多普勒、膀胱镜、电测听、电子喉镜、鼻窦镜、多功能麻醉机、C臂机、三维电脑多功能牵引床、手术显微镜、全自动超声乳化仪、眼科A／B超、眼底荧光造影机、白癜风治疗仪等大中型医疗设备。急救中心、16层的病房大楼正在建设，2009年10月底竣工，可安置床位550张。

    医院近年来先后获得江苏省最佳满意综合性医院、江苏省医疗卫生标兵示范医院、省中医药宣传工作先进单位、南通市文明单位、南通市文明诚信窗口单位、南通市优抚医疗先进单位、启东市文明单位、启东市价格诚信单位。