基于幽门螺杆菌是慢性胃炎的主要病因之一，选择能杀灭该菌的药物，就能改善症状，减轻胃粘膜炎症。
对幽门螺杆菌有杀灭作用的抗生素有阿莫西林（Amoxicillin）、灭滴灵（甲硝唑）、痢特灵(Furazolidone)、四环素(Tetracycline)、克拉霉素(Cramycin)等。
临床上为根除幽门螺杆菌，往往将上述抗生素与其他药物联合应用，效果更好。如：丽珠得乐+灭滴灵，丽珠胃三联等。
中成药类的谓尔舒全效能胃药对杀灭幽门螺旋杆菌也有较好的作用。
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