胃药：酸奶能促进胃酸分泌，而奥美拉唑、雷尼替丁等胃药的作用是抑制胃酸分泌，喝酸奶可能抵消这些药物的部分药效。
抗生素：罗红霉素、多西环素、氯霉素等抗生素会影响酸奶中乳酸菌的活性。酸奶中的钙、镁离子与氧氟沙星、环丙沙星等可产生络合反应，降低药物效果。此外，酸奶可加剧在酸性环境中不稳定的药物(如红霉素、阿莫西林等)的水解，降低疗效。
铁剂：用于治疗贫血的含铁药物(如枸橼酸铁铵、琥珀酸亚铁、多糖铁等)不宜与酸奶同服，因为酸奶中的钙离子可与铁离子在十二指肠中发生竞争，导致铁剂吸收减少，降低疗效。
降糖药：酸奶在发酵的过程中产生了较多乳酸，而二甲双胍、苯乙双胍等双胍类降糖药在发挥药效的同时，会使体内乳酸增多，服这类降糖药期间喝酸奶，可能增大乳酸性酸中毒风险。
如果喝酸奶较多，使胃肠道更偏酸性，包衣片、肠溶片等剂型药物的包衣层可能被破坏，影响疗效。因此，建议服用以上药物期间，最好将服药与喝酸奶的时间隔开两个小时。
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